Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd9P28357 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd9P28357 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms