Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gja4P28235 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja4P28235 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja4P28235 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja4P28235 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja4P28235 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja4P28235 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja4P28235 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja4P28235 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja4P28235 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gja4P28235 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms