Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gabrg3P27681 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gabrg3P27681 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms