Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CftrP26361 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CftrP26361 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CftrP26361 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CftrP26361 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CftrP26361 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CftrP26361 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CftrP26361 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CftrP26361 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CftrP26361 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CftrP26361 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CftrP26361 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CftrP26361 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CftrP26361 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CftrP26361 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CftrP26361 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CftrP26361 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CftrP26361 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CftrP26361 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CftrP26361 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CftrP26361 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CftrP26361 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CftrP26361 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CftrP26361 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CftrP26361 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CftrP26361 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CftrP26361 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CftrP26361 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CftrP26361 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CftrP26361 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CftrP26361 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CftrP26361 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CftrP26361 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CftrP26361 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CftrP26361 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CftrP26361 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CftrP26361 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CftrP26361 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CftrP26361 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CftrP26361 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CftrP26361 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CftrP26361 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CftrP26361 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CftrP26361 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CftrP26361 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CftrP26361 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CftrP26361 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CftrP26361 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CftrP26361 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CftrP26361 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CftrP26361 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CftrP26361 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CftrP26361 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CftrP26361 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CftrP26361 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CftrP26361 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CftrP26361 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CftrP26361 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CftrP26361 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CftrP26361 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CftrP26361 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CftrP26361 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CftrP26361 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CftrP26361 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CftrP26361 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CftrP26361 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CftrP26361 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CftrP26361 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CftrP26361 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CftrP26361 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CftrP26361 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CftrP26361 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CftrP26361 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CftrP26361 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CftrP26361 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CftrP26361 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CftrP26361 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CftrP26361 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CftrP26361 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CftrP26361 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CftrP26361 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CftrP26361 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CftrP26361 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CftrP26361 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CftrP26361 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CftrP26361 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CftrP26361 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CftrP26361 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CftrP26361 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CftrP26361 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CftrP26361 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CftrP26361 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CftrP26361 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CftrP26361 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
CftrP26361 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CftrP26361 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CftrP26361 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CftrP26361 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CftrP26361 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CftrP26361 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms