Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctnna1P26231 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna1P26231 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms