Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myf5P24699 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myf5P24699 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myf5P24699 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myf5P24699 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Myf5P24699 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Myf5P24699 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms