Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gria2P23819 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria2P23819 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms