Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Eif3aP23116 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3aP23116 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms