Protein–RNA interactions for Protein: P22366

Myd88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myd88P22366 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myd88P22366 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myd88P22366 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myd88P22366 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myd88P22366 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Myd88P22366 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myd88P22366 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myd88P22366 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myd88P22366 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms