Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tap1P21958 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tap1P21958 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tap1P21958 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tap1P21958 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tap1P21958 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms