Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Abcb1aP21447 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Abcb1aP21447 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms