Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Myo5bP21271 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5bP21271 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms