Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou5f1P20263 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pou5f1P20263 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms