Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdgfaP20033 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdgfaP20033 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms