Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnc1P19123 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnc1P19123 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms