Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps6ka3P18654 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps6ka3P18654 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms