Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18530 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18530 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18530 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P18530 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18530 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18530 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18530 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18530 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18530 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18530 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18530 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18530 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18530 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18530 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18530 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18530 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18530 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18530 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P18530 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms