Protein–RNA interactions for Protein: P18419

Svs4, Seminal vesicle secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs4P18419 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Svs4P18419 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Svs4P18419 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Svs4P18419 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms