Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpraP18052 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpraP18052 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpraP18052 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpraP18052 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpraP18052 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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