Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rag1P15919 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rag1P15919 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rag1P15919 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rag1P15919 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms