Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf1P15314 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf1P15314 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf1P15314 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf1P15314 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms