Protein–RNA interactions for Protein: P13504

Il1r1, Interleukin-1 receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1r1P13504 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Il1r1P13504 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Il1r1P13504 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms