Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd5P13379 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd5P13379 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms