Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vpreb2P13373 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vpreb2P13373 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms