Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Calb1P12658 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Calb1P12658 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Calb1P12658 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Calb1P12658 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms