Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lamp1P11438 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lamp1P11438 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lamp1P11438 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms