Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fv4P11370 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fv4P11370 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fv4P11370 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fv4P11370 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms