Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PolP11369 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PolP11369 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PolP11369 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PolP11369 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PolP11369 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PolP11369 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PolP11369 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PolP11369 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolP11369 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PolP11369 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolP11369 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolP11369 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolP11369 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolP11369 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolP11369 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolP11369 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PolP11369 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolP11369 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolP11369 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolP11369 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolP11369 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PolP11369 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolP11369 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolP11369 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolP11369 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolP11369 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolP11369 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolP11369 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolP11369 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolP11369 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PolP11369 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PolP11369 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PolP11369 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PolP11369 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PolP11369 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms