Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spp1P10923 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spp1P10923 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spp1P10923 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spp1P10923 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spp1P10923 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms