Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccl3P10855 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl3P10855 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms