Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsbP10605 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsbP10605 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsbP10605 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsbP10605 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtsbP10605 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsbP10605 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtsbP10605 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms