Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd8bP10300 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd8bP10300 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms