Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Schip1P0DPB4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Schip1P0DPB4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms