Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CatspereP0DP43 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CatspereP0DP43 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CatspereP0DP43 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CatspereP0DP43 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CatspereP0DP43 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CatspereP0DP43 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CatspereP0DP43 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CatspereP0DP43 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CatspereP0DP43 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CatspereP0DP43 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CatspereP0DP43 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CatspereP0DP43 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CatspereP0DP43 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CatspereP0DP43 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CatspereP0DP43 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms