Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spta1P08032 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spta1P08032 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spta1P08032 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spta1P08032 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spta1P08032 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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