Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SparcP07214 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SparcP07214 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SparcP07214 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SparcP07214 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SparcP07214 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SparcP07214 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SparcP07214 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SparcP07214 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SparcP07214 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SparcP07214 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SparcP07214 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SparcP07214 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SparcP07214 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SparcP07214 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SparcP07214 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SparcP07214 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SparcP07214 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SparcP07214 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SparcP07214 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SparcP07214 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SparcP07214 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SparcP07214 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SparcP07214 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SparcP07214 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SparcP07214 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SparcP07214 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SparcP07214 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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SparcP07214 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SparcP07214 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SparcP07214 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SparcP07214 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SparcP07214 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SparcP07214 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SparcP07214 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SparcP07214 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SparcP07214 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SparcP07214 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SparcP07214 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SparcP07214 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SparcP07214 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SparcP07214 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SparcP07214 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SparcP07214 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SparcP07214 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SparcP07214 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SparcP07214 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SparcP07214 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SparcP07214 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SparcP07214 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SparcP07214 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SparcP07214 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SparcP07214 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SparcP07214 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SparcP07214 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SparcP07214 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SparcP07214 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SparcP07214 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SparcP07214 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SparcP07214 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms