Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TnfP06804 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TnfP06804 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TnfP06804 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TnfP06804 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TnfP06804 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TnfP06804 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TnfP06804 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TnfP06804 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TnfP06804 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TnfP06804 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TnfP06804 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TnfP06804 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TnfP06804 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TnfP06804 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TnfP06804 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TnfP06804 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TnfP06804 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnfP06804 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnfP06804 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnfP06804 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnfP06804 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnfP06804 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnfP06804 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnfP06804 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnfP06804 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnfP06804 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnfP06804 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnfP06804 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnfP06804 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TnfP06804 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TnfP06804 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TnfP06804 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TnfP06804 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TnfP06804 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TnfP06804 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TnfP06804 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TnfP06804 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TnfP06804 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TnfP06804 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnfP06804 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnfP06804 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnfP06804 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnfP06804 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnfP06804 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnfP06804 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnfP06804 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnfP06804 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnfP06804 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnfP06804 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnfP06804 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnfP06804 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TnfP06804 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TnfP06804 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TnfP06804 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TnfP06804 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TnfP06804 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TnfP06804 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TnfP06804 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TnfP06804 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TnfP06804 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TnfP06804 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TnfP06804 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TnfP06804 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TnfP06804 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TnfP06804 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms