Protein–RNA interactions for Protein: P06797

Ctsl, Cathepsin L1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtslP06797 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtslP06797 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtslP06797 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtslP06797 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtslP06797 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CtslP06797 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtslP06797 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtslP06797 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtslP06797 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtslP06797 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtslP06797 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtslP06797 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtslP06797 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtslP06797 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtslP06797 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtslP06797 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtslP06797 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtslP06797 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtslP06797 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtslP06797 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms