Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06321 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06321 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06321 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06321 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06321 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06321 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms