Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgfb1P04202 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tgfb1P04202 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms