Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01853 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01853 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01853 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P01853 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P01853 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01853 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01853 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P01853 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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