Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01746 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01746 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01746 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01746 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01746 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01746 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01746 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01746 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01746 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01746 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01746 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01746 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01746 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01746 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01746 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01746 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01746 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01746 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01746 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01746 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01746 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01746 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01746 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01746 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01746 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
P01746 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01746 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01746 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01746 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01746 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01746 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01746 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms