Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01735 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01735 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01735 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01735 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01735 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01735 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01735 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01735 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01735 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01735 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01735 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01735 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01735 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01735 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01735 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01735 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01735 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01735 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01735 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01735 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01735 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01735 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01735 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01735 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01735 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms