Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01667 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01667 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01667 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01667 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01667 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01667 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01667 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01667 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01667 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01667 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01667 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01667 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01667 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01667 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01667 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01667 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01667 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01667 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01667 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01667 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01667 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01667 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01667 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01667 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01667 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms