Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01663 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01663 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01663 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01663 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01663 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms