Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01662 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01662 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01662 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01662 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01662 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms