Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01655 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01655 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01655 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01655 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01655 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01655 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01655 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01655 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01655 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01655 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01655 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01655 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01655 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01655 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01655 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01655 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01655 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01655 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01655 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01655 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01655 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01655 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01655 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01655 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01655 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01655 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms