Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lancl1O89112 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms