Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apaf1O88879 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms