Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd160O88875 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd160O88875 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd160O88875 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd160O88875 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd160O88875 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd160O88875 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd160O88875 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd160O88875 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd160O88875 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms